Jeff Leek (vasen) ja Robert Bradley, syntetisoivat Bio -tutkijat ja Fred Hutchinsonin syöpäkeskuksen tutkijat. (LinkedIn -valokuva)
Syntiseze Bio, Seattlen pohjainen startup, jonka perusti Fred Hutchinson -syöpäkeskuksen johtajat, ilmoitti 10 miljoonaa dollaria Madrona Venture Group -rahastoista.
Biotekniikkayrityksen tavoitteena on tehdä uusi lääkkeiden löytäminen nopeammin ja halvemmalla käyttämällä tekoälyä hypoteettisten laboratoriotestien tulosten simuloimiseksi. Ryhmä rakensi sen, mitä kutsutaan generatiiviseksi genomisen perustamallin (GEM-1) ennustamaan geeniekspressiota tarjoamalla tietoa siitä, kuinka uuden lääkkeen odotetaan vaikuttavan solujen käyttäytymiseen.
Syntetisoivat tiistaina Bio -tutkiteet julkaisivat Biorxiville esitetyn esijännityksen, joka selittää mallin ja sen suorituskyvyn, jonka tutkijoiden mukaan “ennustaa geeniekspression tulevia kokeellisia tuloksia tarkkuudella laboratoriotasolla”.
Synthesze Bio on 16 ihmisen ryhmä, ja Fred Hutchin tietojohtaja Jeff Leek ja Robert Bradley, Fred Hutchin integroidun tutkimuskeskuksen johtaja Jeff Leek ja Robert Bradley.
Ryhmä koulutti julkisesti saatavilla olevan tietomallinsa, joka korreloi tutkimuskokeet RNA -sekvensointitietojen kanssa, jotka kuvaavat solussa ekspressoituja geenejä. Tietojoukko sisälsi terveellisiä ja sairaita ihmisen kudoksia, jotka on otettu laboratoriotyöstä ja kliinisistä tutkimuksista.
“Tämä on infrastruktuurin valuuttakurssi, joka määrittelee määrittelyn uudelleen biotieteiden tutkimuksessa”, sanoi Madronan johtaja Matt McIlwain LinkedInissä. “Generatiivisen genomiikan avulla tutkijat voivat kysyä rohkeampia kysymyksiä, suunnitella älykkäämpiä esseitä ja kokeilla hypoteeseja, jotka eivät aiemmin pystyneet tutkimaan.”
Esimerkki syntetisoidusta elämäkerran tekniikasta. (Syntetisoi bio)
Syntetisointiryhmä valmisteli ennakkoluulottoartikkelissaan ongelman, joka yrittää ratkaista. “Monia laboratoriokokeita ei voida tehdä nopeammin kuin solujen kasvavan tai sairauksien nopeus”, yritys kirjoitti, “, kun taas kliinisiä tutkimuksia säätelevät samalla tavalla osallistujien saatavuus ja rekrytointi ja välttämättömät säädökset potilaiden suojelemiseksi.”
He jatkoivat, että AI -mallien generatiiviset kyvyt “tarjoavat mahdollisuuden välttää näitä perustavanlaatuisia biologisia rajoituksia, jotka simuloivat monia tai jopa kaikkia, rajoittaen kokeellisia vaiheita”.
Syntiseze liittyy bioteknologian aloittavien yritysten ja tutkimusryhmien purskeen, jotka kehittävät järjestelmiä Seattlen alueella, joihin sisältyy:
Washingtonin yliopiston proteiinisuunnitteluinstituutti (IPD) käyttää AI: tä rakentaakseen uusia proteiineja, joita voitaisiin käyttää korkean kantaman sairauksien hoidossa. Fred Hutchin johtama Cancer AI -liitto, konsortio, joka sisältää myös Dana-Farberin, Memorial Sloan Ketteringin ja Johns Hopkinsin Allen-instituutin (AI2) ja Google Cloudin tuella. Seattlen synteettisen keskuksen keskuksessa Allen -instituutin, joka käyttää DNA -pohjaista tekniikkaa tallentaakseen solukokemusta ajan myötä. Startup-yritykset, mukaan lukien Xaira Therapeutics, Archon Biosciences, Lila Biologics, Outpace Bio, A-Alpha Bio, Talus Biosciences, Peruna ja monet muut. IPD on täyttänyt vain 10 uutta yritystä.
Muut prefintin kirjoittajat, joiden otsikko on ”Generatiivinen genomiikka ennustaa tarkasti tulevia kokeellisia tuloksia” ovat: Gregory Koytiger, Alice M. Walsh, Vaishali Marar, Kayla A. Johnson, Max Highsmith, Alexander R. Abbas, Andrew Withn, Alex David, Alex David, Alex David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David David Daavid. David, Alex David, Alex David, Alex David, Darren Hui, Jeffrey M. Kahn, Sheng-Yong Niu, Liza J. Ray, Candace Savonen ja Stein Setvik.